Izolace DNA – začátek molekulární identifikace

Již dříve jsme psali, že se nám v rámci projektu podařilo izolovat čisté kmeny mikrořas. Také jsme zmiňovali, že jsme začali hromadit biomasu potřebnou pro molekulární identifikaci (DNA barcoding).

📦 A teď přichází další krok! Začali jsme s izolací DNA z nashromážděné biomasy, která zahrnuje několik po sobě jdoucích kroků:

1️⃣ Lýza buněčných stěn a membrán, následovaná vysrážením a odstraněním zbytků
2️⃣ Navázání DNA na membránu v centrifugační koloně
3️⃣ Promytí, vysušení a eluování DNA

V této fázi potřebujeme řadu laboratorního vybavení: ultrazvukový disruptor, mlýnek, laminární box a digestoř, mnoho mikropipet, různé stojánky a mikrozkumavky, několik centrifug a vortexů, blokový ohřívač a termo-třepačku. Ale to nejdůležitější jsou: znalost metod, individuální přístup ke každému druhu mikrořas a samozřejmě šikovné ruce.

⚗️ Následuje kontrola kvality: pomocí spektrofotometrie a gelové elektroforézy zhodnotíme koncentraci a čistotu získané DNA.

🧬 Dalšími kroky jsou PCR amplifikace, purifikace a odeslání vzorků k sekvenaci. Pak už nás čeká svět bioinformatiky a práce s genetickými daty.

📡 Sledujte náš blog – to nejzajímavější teprve přijde!

#QuarryLifeAward #QLA6